Lietuviškos pavardės „Magūnas“ kilmė siejama su žodžiu „magas“, nusakančiu burtininką, žynį ar stebukladarį. Tai galėjo būti pravardinė pavardė, žyminti išminčius, paslaptingą ar įtaigų asmenį.
Istorijoje žinomi keli žmonės su šia pavardė:
Mykolas Magūnas (1884–1957) – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas.
Viktoras Magūnas (g. 1957) – choro dirigentas ir pedagogas.
Pavardė yra gana reta, bet turi aiškų ryšį su magiška, išskirtine prasme.