Pavardė „Mackūnas“ yra lietuviška, kilusi iš asmenvardžio Mackus (Mato arba Motiejaus trumpinių). Galutinis „-ūnas“ yra būdingas lietuviškos kilmės pavardėms, nurodantis kilmę ar paveldėjimą. Tai gali reikšti „Mackaus vaikas“ arba „iš Mackų giminės“.
Žymiausi žmonės su šia pavarde:
- Giedrius Mackūnas – Lietuvos krepšininkas.
- Mindaugas Mackūnas – politikas, buvantis Šakių rajono meras.
- Stasys Mackūnas – agronomas, daržininkystės specialistas.