Pavardė „Kylys“ kilusi iš žodžio, reiškiančio šakutę, šakelę ar šakotą daiktą. Tai buvo pravardinė pavardė, galėjusi nusakyti žmogų aštrią liežuvį, išradingumą ar net fizinius bruožus.
Istorijoje žymiausias šios pavardės asmuo – Jonas Kylys (apie 1440–1494), Lietuvos Didžiosios Kunigaikštystės valstybinis veikėjas, Naugarduko vaivada ir maršalka.
Trumpai: kilusi iš žodžio „šakutė“, siejama su garsiu LDK valdininku Jonu Kyliu.