Lietuviškos kilmės pavardė, greičiausiai kilusi iš žodžio „krukys“ – senovinis žymėjimas kruvinam, mėsingam žmogui arba žiauriam paukščiui (pvz., vanagui). Gali būti susijusi ir su paukščio kruko arba kruklio pavadinimais, nors etimologija nėra visiškai aiški.
Įžymūs žmonės su šia pavardė:
Jonas Krukys – partizanas, Lietuvos laisvės kovų dalyvis.
Valdas Krukys – verslininkas, ilgametis UAB „Vilniaus baldai“ generalinis direktorius.
Rimantas Krukys – inžinierius, politikas, buvęs LR susisiekimo ministras.