Lietuviškos kilmės pavardė, greičiausiai kilusi iš žodžio „kniušti“ (kniaukti, kniauktelėti), galbūt nusakanti žmogų su aštriu balsu ar ypatingu balsų tonu. Istoriškai paplitusi Žemaitijoje.
Įžymūs žmonės:
Rimantas Kniukšta – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas.
Stasys Kniukšta – žinomas Lietuvos architektas.
Tomas Kniukšta – buvęs profesionalus krepšininkas.