Lietuviškos kilmės, greičiausiai iš asmenvardžio „Klonas“ (galbūt susijęs su žodžiu „klonas“ – šaknis, atžala). Pavardė gali rodyti vietą, kur augo klonai, arba žymėti žmogų, gyvenantį prie klonų.
Įžymūs žmonės:
- Marius Klonauskas – Lietuvos futbolo treneris.
- Tomas Klonauskas – Lietuvos krepšininkas.
Trumpai: pavardė kilusi iš augalo pavadinimo, žinomi sportininkai.