Lietuviškos pavardės „Kerkojis“ kilmė siejama su žodžiu kerkotas, kuris reiškia šakotas, raizgytas, kreivas medis ar šakelė. Tai galėjo būti pravardė žmogui, turinčiam raizgytą laikyseną, kreivą nugarą ar tiesiog gyvenusiam šakotose vietovėse.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
- Kęstutis Kerkojis – Lietuvos teatro režisierius, pedagogas.
- Algirdas Kerkojis – Lietuvos architektas.
Pavardė paplitusi daugiausia Lietuvoje, ypač pietvakariuose (Šakiai, Vilkaviškis).