Pavardė „Kelneraitis“ yra lietuviška, kilusi iš žodžio kelneris (padavėjas), su priesaga -aitis, nurodančia sūnų arba kilmę. Tai patroniminė pavardė, galimai atsiradusi iš tėvo profesijos ar pravardės.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
Vytautas Kelneraitis – žinomas Kauno architektas, projektavęs pastatus tarpukario laikotarpiu.
Mindaugas Kelneraitis – politikas, buvęs Telšių meras ir Seimo narys.