Lietuviška pavardė „Keidonas“ yra kilusi iš baltiškos asmenvardžios šaknies keid-, galbūt susijusios su veiksmažodžiu „keisti“ arba „krypti“. Ji gali būti susiformavusi kaip pravardinė, nurodanti tam tikrus asmens bruožus ar veiksmą.
Istoriniuose šaltiniuose minimas 1667 m. Kėdainių bažnyčios krikšto metrikų įraše – Jonas Keidonas. Šiuolaikinių žymių žmonių su šia pavarde nėra plačiai žinomų.