Tai lietuviška moteriška pavardė, kilusi iš vyriškos formos „Jurkūnas“. Ji nurodo ištekėjusią moterį (Jurkūno žmoną ar našlę). Pavardė yra patroniminė, greičiausiai kilusi iš vardo „Jurkintas“ arba priesagos „-ūnas“ prie žodžio, susijusio su „jautis“ („jurkas“).
Įžymūs žmonės su šia pavardė:
Ona Jurkūnienė – žymi tautodailininkė, kilusi iš Užpalių, kūrusi tradicinius kostiumus ir audimus.
Marija Jurkūnienė – sovietmečio politinė veikėja, buvusi LSSR Ministrų Tarybos pirmininko pavaduotoja.