Pavardė „Juodjurgis“ yra lietuviška, kilusi iš dviejų žodžių: „juodas“ (spalva) ir „jurgis“ (varianto nuo vardo Jurgis). Ji gali reikšti „juodojo Jurgio (žmogus)“ arba būti susijusi su tam tikra vietove ar sodyba. Istoriškai tokios pavardės galėjo kilti iš asmenų, gyvenusių ar dirbusių „Juodajame Jurgyje“ (pvz., dvare, kaime).
Įžymūs žmonės su šia pavardė:
- Kęstutis Juodjurgis – Lietuvos krepšininkas, žaidęs Kauno „Žalgiryje“ ir nacionalinėje rinktinėje.
- Algirdas Juodjurgis – žinomas Lietuvos architektas.
Trumpai: pavardė kilusi iš spalvos ir vardo junginio, susijusi su vieta ar asmeniu, o tarp žymių žmonių – sportininkas ir architektas.