Pavardė „Juodakis“ yra kilusi iš lietuvių žodžio „juodakis“, kuris reiškia žmogų su juodais akimis. Tai buvo pravardė, vėliau perėjusi į pavardę, nurodanti išorinį požymį.
Žymiausi asmenys su šia pavardė:
Stasys Juodakis – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas.
Kazys Juodakis – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas leitenantas.
Marius Juodakis – Lietuvos teatro ir kino aktorius, režisierius.