Pavardė „Junutis“ yra lietuviška, kilusi iš vardo Jonas (Jono sūnus arba Jonas mažybinė forma). Tai patroniminė pavardė, nusakanti giminystės ryšį.
Žymiausias šios pavardės atstovas yra Kazys Junutis (1919–1998) – Lietuvos architektas, vienas žymiausių sovietmečio architektų. Jo projektuoti pastatai: Vilniaus sporto rūmai, Lietuvos nacionalinė filharmonija, Lazdynų mikrorajonas (už kurį 1974 m. apdovanotas LSSR valstybine premija).