Tai patronimas, kilęs iš vardo Jonas. Pavardė reiškia „Jonėlio sūnus“ arba „Jonėlio šeimos atstovas“.
Įžymūs žmonės:
Kęstutis Jonynas (1931–1996) – skulptorius, medalininkas.
Algimantas Jonas Jonynas (g. 1958) – politikas, buvęs Seimo narys.
Juozas Jonila (1912–1997) – kalbininkas, vienas šios pavardės variantų (Jonila) naudotojų.