Pavardė „Jokubaitis“ yra patroniminė, kilusi iš krikšto vardo Jokūbas. Ji reiškia „Jokūbo sūnus“. Lietuviškoje kultūroje tokios pavardės atspindi giminystės ryšius ir buvo dažnos formuojant asmenvardžius.
Įžymūs žmonės su šia pavardė:
- Kęstutis Jokubaitis, žinomas pianistas ir kompozitorius.
- Marius Jokubaitis, krepšininkas, rungtyniavęs Lietuvos klubuose.
- Remigijus Jokubaitis, politikas, buvęs LR socialinės apsaugos ir darbo ministerijos viceministras.
Pavardė paplitusi Lietuvoje ir yra tipiškas lietuviškos antroponimikos pavyzdys.