Lietuviškos pavardės „Japkinas“ kilmė nėra visiškai aiški. Galimas variantas, kad ji yra patroniminė, kilusi iš slaviškos kilmės vyriško vardo „Jopka“ (Jokūbo trumpinio) arba iš žydiškos kilmės vardo „Jankel“ (Jokūbo) trumpinių. Taigi pavardė galėtų reikšti „Jopkos (arba Jankelio) sūnus“.
Žymiausias šios pavardės žmogus – futbolininkas Benjaminas Japkinas (g. 1995 m.), Prancūzijos rinktinės ir tarptautinių klubų gynėjas.