Pavardė „Janukaitis“ yra lietuviška, kilusi iš vardo Jonas (dažniausia baltiškoji šaknis Jan-). Tai patronimas, reiškiantis „Jono sūnus“. Panašios formos – Janukevičius, Jonaitis.
Įžymūs žmonės:
- Algirdas Mykolas Janukaitis – Lietuvos ir TSRS krepšininkas, treneris.
- Justinas Janukaitis – Lietuvos futbolininkas.
- Pavardė taip pat siejama su Viktoru Janukovičiumi (ukrainietiškas atitikmuo, kilęs iš to paties vardo Jonas).