Tai sudėtinė pavardė, jungianti dvi skirtingas šaknis: „Janonis“ (kilusi iš vardo Jonas) ir „Paciūnas“ (greičiausiai kilusi iš žodžio „pociūnas“, reiškiančio jauną, nepatyrusį vyrą arba padėjėją). Tokios pavardės atsirado sudėjus gimines per santuoką arba norint išlaikyti abiejų šeimų pavardes.
Žymiausias asmuo – Arvydas Janonis-Paciūnas (g. 1960 m.), Lietuvos irkluotojas, olimpietis, daugkartinis medalų laimėtojas pasaulio čempionatuose.