Pavardė „Irkinas“ yra lietuviška, greičiausiai kilusi iš asmenvardžio „Irkus“ arba „Irkinas“, kuris galėjo būti pradėtas naudoti kaip pravardė. Gali būti susijusi su žodžiu „irkti“ (liūdėti, raudoti) arba su senuoju baltišku vardu.
Istoriniuose šaltiniuose minima, kad XVI–XVII a. Lietuvoje gyveno bajorų Irkinų giminė, tačiau ji nebuvo plačiai žinoma. Šiuolaikinių žymių žmonių su šia pavarde nėra daug – vienas garsiausių yra Vladas Irkinas (1939–2010), Lietuvos teatro aktorius ir režisierius.