Lietuviška pavardė, kilusi iš žodžių „galas“ ir „naitis“ (mažybinė forma nuo „nagis“). Tai galbūt buvo pramintas žmogus, turėjęs ypatingus nagus arba gyvenęs vietovėje, vadinamoje Galnačiai. Istoriko Simono Daukanto teigimu, pavardė gali būti siejama su žodžiu „galnotis“ (galvoti, mąstyti).
Įžymūs žmonės:
- Kazys Galnaitis (1894–1961) – karininkas, Lietuvos nepriklausomybės akto signataras.
- Viktoras Galnaitis (g. 1958) – politikas, buvęs LR socialinės apsaugos ir darbo ministras.