Lietuviškos pavardės „Gaidžiūnas“ kilmė siejama su žodžiu gaidys (grikių gaidys, gaidukas) ir reiškia gaidžio sūnus arba gaidžio palikuonis. Tai yra viena iš dažnesnių lietuviškų pavardžių, sudaryta pagal tradicinį priesagos -ūnas modelį, nurodantį kilmę ar paveldėjimą.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
Marius Gaidžiūnas – teatro ir kino aktorius.
Jonas Gaidžiūnas – žurnalistas, visuomenės veikėjas.
Zigmas Gaidžiūnas – architektas, visuomenininkas.
Pavardė paplitusi Lietuvoje, ypač vakarinėje dalyje (Žemaitijoje).