Pavardė „Elnionis“ kilusi iš žodžio „elnis“ (gyvūnas elnias), greičiausiai žymi elnio medžiotoją arba žmogų, turėjusį ryšį su elniais. Gali būti susijusi su asmeninėmis savybėmis ar veikla. Lietuvoje žinomi šios pavardės žmonės – futbolininkas Vytautas Elnionis (g. 1996 m.), žaidžiantis saugo pozicijoje.