Lietuviškos pavardės Dunojus kilmė siejama su upės Dunojus vardu. Tai galėjo būti vietovardinis pravardinis pavadinimas, nurodantis gyvenimo prie Dunojaus vietą arba kilmę iš to regiono. Pavardė gali būti ir asmenvardinė – kilusi iš krikšto vardo, susijusio su šia upės vardo simbolika.
Žymūs žmonės:
- Valdas Dunojus – Lietuvos futbolo treneris ir buvęs žaidėjas.
- Algirdas Dunojus – Lietuvos ekonomistas, buvęs LR finansų ministras.