Pavardė „Daukšis-Aleliūnas“ yra sudėtinė, jungianti dvi skirtingas šaknis. „Daukšis“ kilęs iš žodžio daukas (daug, gausus), o „Aleliūnas“ – iš krikšto vardo Aleksejaus (Aleksiejus) arba Aleksandro trumpinių. Tokios pavardės atspindi giminės istoriją, pavyzdžiui, susijungus dviem šeimoms ar įtvirtinant abiejų tėvų pavardes.
Žymiausias jos turėtojas – Jonas Daukšis-Aleliūnas (1909–1985), Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas, aktyvus rezistencijos dalyvis.