Lietuviška vyriška pavardė, kilusi iš asmenvardžio Čižiūnas (dažniausiai siejama su žodžiu „čiūžė“ – bala, pelkė, nendrynė). Gali reikšti „tas, kuris gyvena prie balos“ arba „Čižių (asmenvardžio Čižas) sūnus“.
Įžymūs žmonės:
Kazys Čižiūnas (1894–1941) – karinis veikėjas, pulkininkas.
Stasys Čižiūnas (g. 1946) – ekonomistas, politikas, buvęs LR finansų ministras.
Rolandas Čižiūnas (g. 1979) – teatro ir kino aktorius.