Lietuviška pavardė „Čekys“ yra kilusi iš asmenvardžio Čekys, kuris savo ruožtu greičiausiai atsirado iš slaviškos kilmės vardo Čekas. Šis vardas galėjo būti trumpinys iš Česlavas arba susijęs su etnonimu „čekas“ (žmogus iš Čekijos). Istoriškai tokios pavardės galėjo kilti nuo asmenų, turėjusių ryšių su čekų kraštais arba iš čekų kilusių.
Žymiausi žmonės su šia pavardė:
Stasys Čekys – Lietuvos krepšininkas ir treneris.
Algimantas Čekys – Lietuvos architektas.
Vladas Čekys – Lietuvos teatro aktorius.
Trumpai: pavardė greičiausiai kilusi iš slaviškos šaknies, susijusios su Čekija arba vardu Česlavas, ir žinoma dėl kelių Lietuvos sporto, meno bei architektūros veikėjų.