Lietuviška pavardė „Balniškis“ yra kilusi iš žodžio balnis (žirgas baltos dėmės ant kaklo ar kaktos) ir reiškia balnio savininką ar prižiūrėtoją. Tai buvo pravardė, nurodanti žmogaus užsiėmimą ar bruožą, susijusį su žirgais.
Įžymūs žmonės su šia pavardė:
Kazys Balniškis (1895–1964) – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas.
Juozas Balniškis (g. 1938) – Lietuvos žurnalistas, redaktorius.
Pavardė minima literatūroje (pvz., Vaižganto novelėje „Balniškis“).