Lietuviškos kilmės pavardė, greičiausiai kilusi iš žodžio balkšvas (balsvas, šviesiai pilkas, gelsvas), galbūt nusakantis žmogaus plaukų spalvą ar odos atspalvį. Tai būdvardinės kilmės pavardė.
Įžymūs žmonės:
Rolandas Balkšaitis – Lietuvos ir Sovietų Sąjungos krepšininkas, olimpietis.
Mindaugas Balkšaitis – Lietuvos futbolo teisėjas.
Algirdas Balkšaitis – Lietuvos politikas, buvęs Seimo narys.