Lietuviška pavardė „Baliskaitis“ yra patroniminė, kilusi iš asmenvardžio Balys (Baltramiejus). Priesaga -kaitis nurodo kilmę arba ryšį su tam tikra vietove, dažniausiai – sodyba ar kaimu. Taigi pavardė galėtų reikšti „Balio sūnus iš Balio kaimo / sodybos“.
Istorijoje žymiausias šios pavardės asmuo – Juozas Baliskaitis (1893–1963), Lietuvos kariuomenės karininkas, pulkininkas, aktyvus rezistentas sovietinės okupacijos metais.