Lietuviška pavardė „Babuškis“ yra patroniminis darinys, kilęs iš moteriškos lyties vardo ar pravardės „Baba“ arba „Bob“ (iš slaviškų kalbų, pvz., lenk. baba, rus. баба), su priesaga -uškis, nusakančia kilmę ar priklausomybę. Tiesiogiai pavardė galėtų reikšti „Baba/Bobės sūnus“ arba „priklausantis Babai/Bobei“.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
Jonas Babuškis (1903–1936) – Lietuvos karininkas, aviacijos lakūnas.
Vytautas Babuškis (g. 1939) – Lietuvos irkluotojas, olimpietis.
Tomas Babušis (g. 1979) – Lietuvos žurnalistas, esėistas.
Pavardė paplitusi Lietuvoje, ypač Aukštaitijoje.