Apanaitis yra lietuviška pavardė, kilusi iš asmenvardžio Apanas (dažniausiai trumpinys iš krikšto vardo Atanazas arba Atanasijus). Šaknis siejama su graikišku žodžiu „athanatos“, reiškiančiu nemirtingas.
Žymiausi žmonės su šia pavarde:
- Juozas Apanavičius-Apanaitis (1876–1919) – poetas, vertėjas, visuomenės veikėjas.
- Vytautas Apanaitis (g. 1941) – ekonomistas, politikas, buvęs LR finansų ministras.
- Algirdas Apanaitis (g. 1955) – teatro režisierius, pedagogas.
- Jonas Apanaitis (1906–1994) – architektas, inžinierius.
Trumpai: pavardė reiškia „Apano sūnus“ ir atspindi tradicinę lietuvišką pavardžių darybą.