Lietuviška pavardė „Ambotavičius“ kilusi iš asmenvardžio Ambotas, kuris savo ruožtu siejasi su žodžiu „ambotas“ (reliškasis altorius, pagonių aukuras). Tai patroniminė pavardė, reiškianti „Amboto sūnus“ arba „Amboto giminės“.
Istorijoje žymiausias jos turėtojas – Jonas Ambotavičius (apie 1620–1674), Lietuvos Didžiosios Kunigaikštystės raštijos darbuotojas, kalbininkas, daugiausia žinomas kaip vienas pirmųjų lietuviškų gramatikų autorių („Grammaticæ Litvanicæ“). Jo veikla prisidėjo prie lietuvių kalbos norminimo.
Trumpai: pavardė kilusi iš religinio termino, o garsiausias jos atstovas – XVII a. kalbininkas Jonas Ambotavičius.